どちらも良い所がありますし個人の好みなのでお好きな方をどうぞお選びくださいませ。セキュリティを重視するのか、プライバシーを重視するのか、高いところに住みたいのか、庭で土いじりをしたいのか、などなどですね。
一戸建てはマンションと違って駐車場代や管理費や修繕積立金はありません。ただしメンテナンスは自己管理となりますので余裕があれば多少の積立てはされた方がいいかもです。のちのちの費用としては、防蟻(シロアリ)費用や外壁塗装などといったところです。
マンションの場合は上記以外の費用負担は基本無いと思いますが大規模修繕工事(12~13年位に一度)の際に建築費高騰や消費税増などで修繕積立金が足らず月々の額が増額されるケースも良く耳にしますので修繕積立金が安いからといって飛びつかないようご注意下さいませ。またご購入のタイミングで増額などの話は出ていなくても先の先の将来には起こり得る話かも…と。